48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0308 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  49.18 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  47.69 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  42.26 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  40.6 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  43.83 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  38.62 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  41.28 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  38.2 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  40.68 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  42.15 
 
 		 293 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  39.08 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  39.08 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  38.66 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  36.44 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  39.08 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  45.49 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  39.92 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  42.13 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  37.13 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  36.03 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  34.34 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  37.89 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  35.39 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  40.17 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  35.16 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  32.14 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  34.6 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  37.89 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  39.32 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  34.18 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  34.18 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  28.7 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  31.78 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  29.33 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  31.17 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  35.32 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  28.41 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  36.41 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  28.99 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  41.54 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  41.94 
 
 		 164 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  41.94 
 
 		 172 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  28.1 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  27.6 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  30.52 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>