45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0645 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  497  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  38.8 
 
 
275 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  38.43 
 
 
263 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  35.34 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  41.8 
 
 
266 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  41.7 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  35.86 
 
 
255 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  35.62 
 
 
255 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  35.36 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  37.61 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  35.04 
 
 
246 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  36.73 
 
 
265 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  34.76 
 
 
246 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  35.09 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  35.04 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  36.32 
 
 
257 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  40.08 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  34.57 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  37.17 
 
 
265 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  37.17 
 
 
265 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  34.6 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  39.11 
 
 
250 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  35.19 
 
 
252 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  34.18 
 
 
240 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  34.18 
 
 
240 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  34.18 
 
 
240 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  32.62 
 
 
265 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  36 
 
 
266 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  32.49 
 
 
240 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  30.56 
 
 
304 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  34.65 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  36.65 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  32.78 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  34.62 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  37.57 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  29.96 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  31.7 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  27.57 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  35.63 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  35.63 
 
 
164 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  39.71 
 
 
141 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
141 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  39.71 
 
 
141 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>