46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2488 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  490  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  58 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  44.09 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  45.25 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  42.64 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  42.97 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  43.2 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  41.67 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  43.65 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  42.8 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  40.55 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  44.76 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  45.76 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  40.31 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  41.5 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  41.5 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  40.32 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  40.3 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  40.71 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  40.87 
 
 		 240 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  37.64 
 
 		 266 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  45.63 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  39.15 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  44.71 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  43.15 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  35.52 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  35.69 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  38.08 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  34.26 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  37.55 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  37.55 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  33.2 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  35.46 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  32.39 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  36.44 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  35.43 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  32.57 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  27.39 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  36.32 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  42.65 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  42.65 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  42.65 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  42.65 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  42.65 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  29.55 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  27.13 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>