44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2600 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  91.06 
 
 
246 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  76.62 
 
 
255 aa  357  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  77.16 
 
 
239 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  83.12 
 
 
240 aa  349  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  81.03 
 
 
240 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  80.6 
 
 
240 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  80.6 
 
 
240 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  78.02 
 
 
240 aa  328  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  70.04 
 
 
255 aa  314  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  56.03 
 
 
252 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  56.28 
 
 
248 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  47.37 
 
 
263 aa  225  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  56.02 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  51.75 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  50.65 
 
 
238 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  51.5 
 
 
266 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  44.53 
 
 
265 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  40.71 
 
 
263 aa  174  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  39.92 
 
 
268 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  41 
 
 
263 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  42.74 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  40.34 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  45.49 
 
 
248 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  34.83 
 
 
289 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  40.78 
 
 
266 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  39.74 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  40.34 
 
 
304 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  42.34 
 
 
259 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  38.05 
 
 
265 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  36.8 
 
 
293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  37.17 
 
 
265 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  37.17 
 
 
265 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  32.81 
 
 
275 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  40.09 
 
 
264 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  34.12 
 
 
256 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  36.11 
 
 
250 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  32.87 
 
 
224 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  56.58 
 
 
141 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  55.26 
 
 
141 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  55.41 
 
 
141 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  55.41 
 
 
164 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  55.41 
 
 
172 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  31.6 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>