45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5177 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  97.92 
 
 		 239 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  89.17 
 
 		 240 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  90 
 
 		 240 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  89.17 
 
 		 240 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  89.17 
 
 		 240 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  78.02 
 
 		 246 aa  357  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  72.31 
 
 		 246 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  73.59 
 
 		 255 aa  337  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  66.67 
 
 		 255 aa  294  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  55.6 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  57.14 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  45.75 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  55.83 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  52.16 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  47.58 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  48.07 
 
 		 266 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  43.85 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  45.8 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  42.74 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  39.54 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  42.32 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  34.67 
 
 		 289 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  37.94 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  38.24 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  38.11 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  40.64 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  36.86 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  37.34 
 
 		 304 aa  134  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  36.75 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  36.02 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  36.02 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  34.92 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  36.65 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  34.43 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  34.1 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  35.51 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  55.29 
 
 		 141 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  55.29 
 
 		 141 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  55.42 
 
 		 164 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  55.42 
 
 		 172 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  55.42 
 
 		 141 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  32.03 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  29.63 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  28.68 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.473555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>