1613 genes were found for organism Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cla_0001  CDS  NC_012039  1329  1329  chromosomal replication initiation protein  YP_002574620  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0002  CDS  NC_012039  1462  2529  1068  DNA polymerase III subunit beta  YP_002574621  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0003  CDS  NC_012039  2539  4857  2319  DNA gyrase subunit B  YP_002574622  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0004  CDS  NC_012039  4866  5858  993  putative adenosine deaminase  YP_002574623  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0005  CDS  NC_012039  5855  6856  1002  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  YP_002574624  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0006  CDS  NC_012039  6832  7215  384  7-cyano-7-deazaguanine reductase  YP_002574625  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0007  CDS  NC_012039  7387  8637  1251  molybdopterin oxidoreductase family protein  YP_002574626  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0008  CDS  NC_012039  8640  8975  336  hypothetical protein  YP_002574627  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0009  CDS  NC_012039  9018  9662  645  possible outer membrane protein  YP_002574628  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0010  CDS  NC_012039  9672  9881  210  conserved hypothetical protein, PhnA family  YP_002574629  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0011  CDS  NC_012039  9895  10527  633  FAD-dependent thymidylate synthase  YP_002574630  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0012  CDS  NC_012039  10627  12264  1638  CTP synthetase  YP_002574631  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0013  CDS  NC_012039  12254  13825  1572  single-stranded-DNA specific exonuclease  YP_002574632  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0014  CDS  NC_012039  13894  14472  579  conserved hypothetical protein, SLT family  YP_002574633  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0015  CDS  NC_012039  14482  15549  1068  peptide chain release factor 1  YP_002574634  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0016  CDS  NC_012039  15553  15816  264  30S ribosomal protein S20  YP_002574635  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0017  CDS  NC_012039  16105  16866  762  putative ribosomal pseudouridine synthase  YP_002574636  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0018  CDS  NC_012039  16876  18834  1959  metallo-beta-lactamase family protein  YP_002574637  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0019  CDS  NC_012039  18800  19621  822  dimethyladenosine transferase  YP_002574638  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0020  CDS  NC_012039  19712  20245  534  conserved hypothetical protein, putative purine nucleoside phosphorylase  YP_002574639  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0021  CDS  NC_012039  20254  21324  1071  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  YP_002574640  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0022  CDS  NC_012039  21421  22431  1011  hypothetical protein  YP_002574641  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0023  CDS  NC_012039  22428  23330  903  putative ribosomal pseudouridine synthase  YP_002574642  normal  0.835317  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0024  CDS  NC_012039  23410  24738  1329  adenylosuccinate lyase  YP_002574643  normal  0.938099  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0025  CDS  NC_012039  24752  27127  2376  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  YP_002574644  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0026  CDS  NC_012039  27143  29128  1986  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  YP_002574645  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0027  CDS  NC_012039  29125  29931  807  undecaprenol kinase, putative  YP_002574646  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0028  CDS  NC_012039  30038  31849  1812  threonyl-tRNA synthetase  YP_002574647  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0029  CDS  NC_012039  31846  32367  522  translation initiation factor IF-3  YP_002574648  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0030  CDS  NC_012039  32401  33492  1092  D12-class N6-adenine-specific DNA methyltransferase  YP_002574649  normal  0.678674  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0031  CDS  NC_012039  33489  34355  867  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  YP_002574650  normal  0.718657  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0032  CDS  NC_012039  34434  35858  1425  conserved hypothetical protein, putative VWA domain protein  YP_002574651  normal  0.822803  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0033  CDS  NC_012039  35890  37572  1683  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  YP_002574652  normal  0.836793  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0034  CDS  NC_012039  37745  37936  192  50S ribosomal protein L35  YP_002574653  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0035  CDS  NC_012039  38034  38387  354  50S ribosomal protein L20  YP_002574654  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0036  CDS  NC_012039  38335  39273  939  DNA ligase  YP_002574655  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0037  CDS  NC_012039  39283  40092  810  cation ABC transporter, permease protein  YP_002574656  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0038  CDS  NC_012039  40085  40834  750  cation ABC transporter, ATP-binding protein  YP_002574657  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0039  CDS  NC_012039  40831  41667  837  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  YP_002574658  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0040  CDS  NC_012039  41728  42426  699  hypothetical protein  YP_002574659  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0041  CDS  NC_012039  42436  43428  993  dihydroorotase  YP_002574660  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0042  CDS  NC_012039  43437  43667  231  hypothetical protein  YP_002574661  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0043  CDS  NC_012039  43652  44023  372  diacylglycerol kinase  YP_002574662  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0044  CDS  NC_012039  44023  45555  1533  conserved hypothetical protein, putative sulfatase  YP_002574663  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0045  CDS  NC_012039  45654  46412  759  exodeoxyribonuclease III  YP_002574664  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0046  tRNA  NC_012039  46482  46553  72  tRNA-Glu    normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0047  CDS  NC_012039  46766  47380  615  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  YP_002574665  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0048  CDS  NC_012039  47512  49791  2280  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  YP_002574666  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0049  CDS  NC_012039  49739  50272  534  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase activating protein  YP_002574667  normal  0.887207  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0050  CDS  NC_012039  50340  50993  654  superoxide dismutase (Fe)  YP_002574668  normal  0.408378  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0051  CDS  NC_012039  51053  52426  1374  putative C4-dicarboxylate transporter  YP_002574669  normal  0.211631  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0052  CDS  NC_012039  52449  53438  990  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  YP_002574670  hitchhiker  0.00129259  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0053  CDS  NC_012039  53497  54078  582  dephospho-CoA kinase  YP_002574671  hitchhiker  8.02495e-05  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0054  CDS  NC_012039  54089  54838  750  diaminopimelate epimerase  YP_002574672  hitchhiker  5.06343e-07  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0055  CDS  NC_012039  54813  55520  708  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  YP_002574673  hitchhiker  3.59095e-08  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0056  CDS  NC_012039  55517  56578  1062  conserved hypothetical ATP-binding protein  YP_002574674  hitchhiker  1.12269e-07  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0057  tRNA  NC_012039  56601  56673  73  tRNA-Ala    hitchhiker  1.21136e-10  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0058  CDS  NC_012039  56900  57211  312  30S ribosomal protein S10  YP_002574675  hitchhiker  3.17741e-14  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0059  CDS  NC_012039  57221  57796  576  50S ribosomal protein L3  YP_002574676  decreased coverage  6.39539e-19  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0060  CDS  NC_012039  57793  58407  615  50S ribosomal protein L4  YP_002574677  hitchhiker  3.0492e-16  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0061  CDS  NC_012039  58409  58690  282  50S ribosomal protein L23  YP_002574678  hitchhiker  4.83414e-12  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0062  CDS  NC_012039  58692  59522  831  50S ribosomal protein L2  YP_002574679  hitchhiker  1.24196e-07  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0063  CDS  NC_012039  59524  59805  282  30S ribosomal protein S19  YP_002574680  hitchhiker  0.000375737  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0064  CDS  NC_012039  59817  60191  375  50S ribosomal protein L22  YP_002574681  hitchhiker  0.000282721  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0065  CDS  NC_012039  60193  60894  702  30S ribosomal protein S3  YP_002574682  hitchhiker  0.00223028  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0066  CDS  NC_012039  60897  61322  426  50S ribosomal protein L16  YP_002574683  hitchhiker  0.0038879  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0067  CDS  NC_012039  61309  61494  186  50S ribosomal protein L29  YP_002574684  hitchhiker  0.00273848  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0068  CDS  NC_012039  61504  61755  252  30S ribosomal protein S17  YP_002574685  hitchhiker  0.00143996  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0069  CDS  NC_012039  61755  62123  369  50S ribosomal protein L14  YP_002574686  normal  0.0106985  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0070  CDS  NC_012039  62123  62350  228  50S ribosomal protein L24  YP_002574687  normal  0.033879  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0071  CDS  NC_012039  62352  62897  546  50S ribosomal protein L5  YP_002574688  normal  0.0205797  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0072  CDS  NC_012039  62899  63084  186  30S ribosomal protein S14  YP_002574689  normal  0.15286  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0073  CDS  NC_012039  63097  63492  396  30S ribosomal protein S8  YP_002574690  normal  0.200652  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0074  CDS  NC_012039  63569  64105  537  50S ribosomal protein L6  YP_002574691  normal  0.54113  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0075  CDS  NC_012039  64116  64472  357  50S ribosomal protein L18  YP_002574692  normal  0.820764  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0076  CDS  NC_012039  64456  64932  477  30S ribosomal protein S5  YP_002574693  normal  0.504275  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0077  CDS  NC_012039  64936  65328  393  50S ribosomal protein L15  YP_002574694  normal  0.298672  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0078  CDS  NC_012039  65328  66590  1263  preprotein translocase subunit SecY  YP_002574695  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0079  CDS  NC_012039  66631  67371  741  glutamate racemase  YP_002574696  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0080  CDS  NC_012039  67472  68518  1047  L-asparaginase  YP_002574697  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0081  CDS  NC_012039  68602  69249  648  rubrerythrin  YP_002574698  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0082  CDS  NC_012039  69304  69777  474  hypothetical protein  YP_002574699  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0083  CDS  NC_012039  69777  70328  552  ribonuclease HII  YP_002574700  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0084  CDS  NC_012039  70708  72030  1323  L-serine transporter  YP_002574701  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0085  CDS  NC_012039  72042  73409  1368  L-serine dehydratase  YP_002574702  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0086  CDS  NC_012039  73499  74254  756  methionine aminopeptidase  YP_002574703  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0087  CDS  NC_012039  74271  76073  1803  MCP-domain signal transduction protein  YP_002574704  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0088  CDS  NC_012039  76057  76977  921  cytochrome c551 peroxidase  YP_002574705  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0089  CDS  NC_012039  77034  78323  1290  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  YP_002574706  normal  0.964688  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0090  CDS  NC_012039  78457  78675  219  translation initiation factor IF-1  YP_002574707  normal  0.146045  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0091  CDS  NC_012039  78851  78964  114  50S ribosomal protein L36  YP_002574708  normal  0.0580273  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0092  CDS  NC_012039  78968  79333  366  30S ribosomal protein S13  YP_002574709  normal  0.0157087  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0093  CDS  NC_012039  79343  79735  393  30S ribosomal protein S11  YP_002574710  normal  0.0385676  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0094  CDS  NC_012039  79766  80392  627  30S ribosomal protein S4  YP_002574711  normal  0.0810213  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0095  CDS  NC_012039  80407  81420  1014  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  YP_002574712  normal  0.0151927  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0096  CDS  NC_012039  81424  81777  354  50S ribosomal protein L17  YP_002574713  hitchhiker  0.000142816  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0097  CDS  NC_012039  81888  82787  900  ATP phosphoribosyltransferase  YP_002574714  hitchhiker  1.83123e-05  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0098  CDS  NC_012039  82797  84077  1281  histidinol dehydrogenase  YP_002574715  hitchhiker  7.36266e-05  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0099  CDS  NC_012039  84074  85141  1068  imidazole glycerol-phosphate dehydratase/histidinol phosphatase  YP_002574716  hitchhiker  1.15008e-11  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_0100  CDS  NC_012039  85175  85906  732  hypothetical protein  YP_002574717  unclonable  6.44267e-20  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>