50 genes were found for organism Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rru_B0001  CDS  NC_007641  254  904  +  651  putative partition protein  YP_425037  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0002  CDS  NC_007641  976  1224  +  249  hypothetical protein  YP_425038  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0003  CDS  NC_007641  1305  2369  +  1065  glycosyl transferase, group 1  YP_425039  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0004  CDS  NC_007641  2379  3008  -  630  hypothetical protein  YP_425040  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0005  CDS  NC_007641  3063  5189  -  2127  glycosyl transferase  YP_425041  normal  0.164795  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0006  CDS  NC_007641  5259  6218  -  960  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_425042  normal  0.312436  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0007  CDS  NC_007641  6225  9935  -  3711  glycosyl transferase, group 1  YP_425043  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0008  CDS  NC_007641  10555  10806  +  252  putative fragment of transposase protein  YP_425044  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0009  CDS  NC_007641  10834  11760  +  927  transposase  YP_425045  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0010  CDS  NC_007641  12479  13036  -  558  resolvase  YP_425046  normal  0.0319649  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0011  CDS  NC_007641  13049  13348  -  300  hypothetical protein  YP_425047  normal  0.0342908  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0012  CDS  NC_007641  13409  13675  -  267  DNA polymerase, beta-like region  YP_425048  normal  0.0162009  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0013  CDS  NC_007641  13859  14095  +  237  hypothetical protein  YP_425049  normal  0.0298502  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0014  CDS  NC_007641  14096  15022  -  927  transposase  YP_425050  normal  0.220216  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0015  CDS  NC_007641  15050  15301  -  252  putative fragment of transposase protein  YP_425051  normal  0.0395238  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0016  CDS  NC_007641  15468  16091  +  624  Phage integrase  YP_425052  normal  0.0260754  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0017  CDS  NC_007641  16441  17346  +  906  LysR family transcriptional regulator  YP_425053  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0018  CDS  NC_007641  17434  18111  +  678  hypothetical protein  YP_425054  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0019  CDS  NC_007641  18229  18918  +  690  O-methyltransferase family protein  YP_425055  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0020  CDS  NC_007641  18918  20465  +  1548  major facilitator transporter  YP_425056  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0021  CDS  NC_007641  21078  21272  -  195  DNA-binding protein Fis  YP_425057  normal  0.316205  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0022  CDS  NC_007641  21316  21717  -  402  resolvase-like protein  YP_425058  normal  0.119432  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0023  CDS  NC_007641  21900  22385  +  486  hypothetical protein  YP_425059  normal  0.0873848  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0024  CDS  NC_007641  22802  23734  -  933  RepA-related protein  YP_425060  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0025  CDS  NC_007641  23871  24122  -  252  hypothetical protein  YP_425061  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0026  CDS  NC_007641  24461  25255  +  795  SapC  YP_425062  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0027  CDS  NC_007641  25539  26258  +  720  hypothetical protein  YP_425063  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0028  CDS  NC_007641  26248  27666  +  1419  ABC transporter related  YP_425064  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0029  CDS  NC_007641  27680  28666  -  987  plasmid encoded RepA protein  YP_425065  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0030  CDS  NC_007641  28989  30377  -  1389  hemolysin-type calcium-binding region  YP_425066  normal  0.328921  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0031  CDS  NC_007641  30461  31993  -  1533  hypothetical protein  YP_425067  normal  0.878298  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0032  CDS  NC_007641  32076  32378  -  303  hypothetical protein  YP_425068  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0033  CDS  NC_007641  32481  33188  -  708  hypothetical protein  YP_425069  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0034  CDS  NC_007641  33307  33534  +  228  hypothetical protein  YP_425070  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0035  CDS  NC_007641  33531  33917  +  387  death-on-curing protein  YP_425071  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0036  CDS  NC_007641  33946  35112  -  1167  hypothetical protein  YP_425072  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0037  CDS  NC_007641  35373  37865  -  2493  hemolysin-type calcium-binding region  YP_425073  normal  0.475959  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0038  CDS  NC_007641  38320  38886  +  567  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  YP_425074  normal  0.262213  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0039  CDS  NC_007641  39009  40766  +  1758  Type I secretion system ATPase, PrtD  YP_425075  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0040  CDS  NC_007641  40773  42251  +  1479  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  YP_425076  normal  0.0639189  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0041  CDS  NC_007641  42399  42710  +  312  XRE family transcriptional regulator  YP_425077  normal  0.0601255  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0042  CDS  NC_007641  42745  43599  +  855  hypothetical protein  YP_425078  normal  0.448572  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0043  CDS  NC_007641  43703  44356  +  654  hypothetical protein  YP_425079  normal  0.543786  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0044  CDS  NC_007641  44416  46656  +  2241  glycosyl transferase family protein  YP_425080  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0045  CDS  NC_007641  46714  48117  +  1404  phosphomannomutase  YP_425081  normal  0.109324  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0046  CDS  NC_007641  48155  49639  +  1485  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  YP_425082  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0047  CDS  NC_007641  49682  50716  +  1035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_425083  normal  0.436263  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0048  CDS  NC_007641  50713  51597  -  885  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  YP_425084  normal  0.231271  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0049  CDS  NC_007641  51594  52526  -  933  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  YP_425085  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Rru_B0050  CDS  NC_007641  52529  53584  -  1056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  YP_425086  normal  1  n/a    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>