27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0023 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0023  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  317  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0873848  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  39.55 
 
 		 1006 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  39.55 
 
 		 1006 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  43.36 
 
 		 990 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  50.67 
 
 		 986 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6380  Tn5044 transposase  39.23 
 
 		 254 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  39.58 
 
 		 999 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  39.58 
 
 		 999 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  39.58 
 
 		 999 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  39.58 
 
 		 999 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  37.8 
 
 		 1013 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  37.76 
 
 		 994 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  37.5 
 
 		 993 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  37.5 
 
 		 993 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  34.23 
 
 		 1059 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  36.94 
 
 		 989 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  41.98 
 
 		 536 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 995 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  32.73 
 
 		 990 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  35 
 
 		 1028 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  31.85 
 
 		 1012 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  35.48 
 
 		 1004 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  35.48 
 
 		 1004 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  36 
 
 		 1007 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  36 
 
 		 1007 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5145  transposase Tn3  33.75 
 
 		 335 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  32.08 
 
 		 995 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>