38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6380 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6380  Tn5044 transposase  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  63.83 
 
 		 993 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  63.83 
 
 		 993 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  56.6 
 
 		 994 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  48.51 
 
 		 989 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  38.56 
 
 		 995 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  37.24 
 
 		 995 aa  148  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  38.43 
 
 		 990 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  32.25 
 
 		 1006 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  32.25 
 
 		 1006 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  30.84 
 
 		 536 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  30.51 
 
 		 990 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  31.35 
 
 		 999 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  31.35 
 
 		 999 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  31.35 
 
 		 999 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  31.35 
 
 		 999 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  29.11 
 
 		 1004 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  33.2 
 
 		 986 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  32.65 
 
 		 1059 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  30.96 
 
 		 1028 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  28.45 
 
 		 1007 aa  99.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  28.45 
 
 		 1007 aa  99.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  33.17 
 
 		 1012 aa  98.6  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  27.89 
 
 		 1013 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5145  transposase Tn3  26.45 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  27.16 
 
 		 1004 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  27.16 
 
 		 1004 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0023  hypothetical protein  41.44 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0873848  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  25.42 
 
 		 499 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  25.42 
 
 		 499 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  27.49 
 
 		 988 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  27.49 
 
 		 988 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  28.94 
 
 		 988 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  28.94 
 
 		 988 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  28.94 
 
 		 988 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  27.01 
 
 		 988 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  26.07 
 
 		 988 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  26.58 
 
 		 1028 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>