36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2383 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  45.26 
 
 
210 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  46.12 
 
 
210 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  41.6 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  42.34 
 
 
242 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  46.55 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  46.43 
 
 
216 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  46.53 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  35.91 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  39.42 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  28.39 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  38.54 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  37.5 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  33.71 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  45.45 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  39.6 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  38.61 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  44.32 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  44.32 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  44.32 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  31.66 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  39.6 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  33.13 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  33.73 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  46.34 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  35.64 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  31.47 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  46.34 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  46.34 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  45.12 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  45.12 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  45.12 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  30.95 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  36.63 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>