36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2935 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  85.71 
 
 		 222 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  58.9 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  50.41 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  50.21 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  51.02 
 
 		 249 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  45.15 
 
 		 248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  45.15 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  51.93 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  49.39 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  49 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  46.76 
 
 		 216 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  47.58 
 
 		 249 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  47.58 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  46.22 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  46.22 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  49.36 
 
 		 249 aa  197  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  49.36 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  46.18 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  48.93 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  45.16 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  48.93 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  38.87 
 
 		 243 aa  165  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  35.98 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  41.5 
 
 		 229 aa  158  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  41.94 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  41.53 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  40.73 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  39.02 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  37.55 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  51.04 
 
 		 96 aa  105  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  28.35 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  39.64 
 
 		 210 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  39.64 
 
 		 210 aa  85.5  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  38.35 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>