36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0327 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  513  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  94.44 
 
 
252 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  92.86 
 
 
252 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  60.48 
 
 
250 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  58.33 
 
 
250 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  40.78 
 
 
243 aa  198  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  43.3 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  42.15 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  36.9 
 
 
249 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  42.86 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  42.41 
 
 
249 aa  178  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  36.51 
 
 
249 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  39.26 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  40.08 
 
 
249 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  38.84 
 
 
249 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  38.5 
 
 
248 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  38.5 
 
 
248 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  38.96 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  38.84 
 
 
249 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  39.26 
 
 
249 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  39.64 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  38.99 
 
 
216 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  40.18 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  39.84 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  42.47 
 
 
222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  39.26 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  38.43 
 
 
249 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  39.9 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  41.4 
 
 
242 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  38.13 
 
 
253 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  36.18 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  29.57 
 
 
254 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  48.96 
 
 
96 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  39.6 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  31.71 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>