36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1753 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  41.35 
 
 
248 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  42.06 
 
 
243 aa  184  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  40.51 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  42.59 
 
 
216 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  91.67 
 
 
96 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  39.75 
 
 
249 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  39.75 
 
 
249 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  38.75 
 
 
249 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  41.31 
 
 
222 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  41.63 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  43.52 
 
 
249 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  37.5 
 
 
252 aa  158  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  38.31 
 
 
252 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  38.68 
 
 
249 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  37.86 
 
 
249 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  43.06 
 
 
249 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  38.75 
 
 
249 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  43.06 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  38.59 
 
 
250 aa  154  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  37.08 
 
 
249 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  39.58 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  36.7 
 
 
242 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  40.19 
 
 
253 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  41.63 
 
 
249 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  38.27 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  36.84 
 
 
253 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  37.04 
 
 
249 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  37.45 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  33.19 
 
 
243 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  29.08 
 
 
254 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  26.57 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  31.15 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  37.5 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>