36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0674 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  82.33 
 
 		 249 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  81.53 
 
 		 249 aa  367  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  81.53 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  75.9 
 
 		 249 aa  364  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  66.27 
 
 		 249 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  66.67 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  66.27 
 
 		 249 aa  332  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  65.86 
 
 		 249 aa  327  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  65.06 
 
 		 249 aa  321  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  66.67 
 
 		 249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  66.27 
 
 		 249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  66.67 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  65.61 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  53.01 
 
 		 248 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  52.21 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  54.62 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  54.22 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  56.74 
 
 		 216 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  45.38 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  48.61 
 
 		 242 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  46.98 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  40.56 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  40.5 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  39.67 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  41.38 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  40.64 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  39.5 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  37.6 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  47.92 
 
 		 96 aa  101  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  28.41 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  35.48 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>