36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0646 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  100 
 
 		 250 aa  503  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  74.6 
 
 		 250 aa  343  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  58.73 
 
 		 252 aa  279  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  58.33 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  55.56 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  41.2 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  40.24 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  37.55 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  37.15 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  38.96 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  37.6 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  36.72 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  36.72 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  38.87 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  39.6 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  39.3 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  40.57 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  38 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  37.6 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  37.6 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  37.8 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  37.2 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  39.44 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  40.62 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  34.8 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  40.17 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  37.61 
 
 		 216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  40.18 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  35.18 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  38.46 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  31.91 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  46.88 
 
 		 96 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  39.22 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  30.91 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  30.91 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>