37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0880 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  98.39 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  65.46 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  65.46 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  69.59 
 
 		 216 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  53.41 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  55.02 
 
 		 249 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  55.82 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  55.82 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  55.42 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  51.41 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  51.41 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  51 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  51 
 
 		 249 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  50.2 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  50.59 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  49.8 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  49.4 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  55.6 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  49.8 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  42.97 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  47.62 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  45.83 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  45.62 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  36.9 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  36.51 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  36.9 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  41 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  37.55 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  35.74 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  47.92 
 
 		 96 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  40.87 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  40.87 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  50 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  28.28 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5225  hypothetical protein  29.5 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>