36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2207 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  98.39 
 
 
249 aa  494  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  97.59 
 
 
249 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  78.31 
 
 
249 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  81.53 
 
 
249 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  69.08 
 
 
249 aa  342  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  69.48 
 
 
249 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  69.88 
 
 
249 aa  339  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  69.48 
 
 
249 aa  332  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  69.48 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  65.46 
 
 
249 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  67.07 
 
 
249 aa  330  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  68.67 
 
 
249 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  68.77 
 
 
253 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  67.98 
 
 
253 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  55.42 
 
 
248 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  54.62 
 
 
248 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  56.22 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  55.82 
 
 
249 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  58.64 
 
 
216 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  44.98 
 
 
243 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  49.37 
 
 
242 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  46.98 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  41.77 
 
 
252 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  41.77 
 
 
252 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  40.5 
 
 
252 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  42.44 
 
 
229 aa  168  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  42.5 
 
 
243 aa  158  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  32.93 
 
 
242 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  38.8 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  39 
 
 
250 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  47.92 
 
 
96 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  28.03 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  42.86 
 
 
210 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  42.86 
 
 
210 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  42.16 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>