36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  99.54 
 
 
248 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  98.61 
 
 
248 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  70.05 
 
 
249 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  69.59 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  58.64 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  58.64 
 
 
249 aa  242  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  58.18 
 
 
249 aa  241  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  54.84 
 
 
249 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  56.74 
 
 
249 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  55.35 
 
 
249 aa  227  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  51.61 
 
 
249 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  53.46 
 
 
249 aa  222  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  53.46 
 
 
249 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  51.16 
 
 
249 aa  222  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  50.47 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  52.49 
 
 
253 aa  214  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  52.07 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  52.07 
 
 
249 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  47.25 
 
 
243 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  51.61 
 
 
249 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  46.92 
 
 
242 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  48.61 
 
 
222 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  43.22 
 
 
229 aa  169  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  40.18 
 
 
243 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  38.99 
 
 
252 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  38.43 
 
 
252 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  38.14 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  38.57 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  37.33 
 
 
250 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  52.08 
 
 
96 aa  111  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  35.43 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  41.84 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  45.79 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  30.26 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>