36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4170 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  93.28 
 
 
253 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  92.09 
 
 
249 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  91.7 
 
 
249 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  91.3 
 
 
249 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  90.12 
 
 
249 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  89.33 
 
 
249 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  77.87 
 
 
249 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  76.28 
 
 
249 aa  377  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  66.01 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  63.24 
 
 
249 aa  308  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  67.98 
 
 
249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  67.98 
 
 
249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  67.19 
 
 
249 aa  304  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  65.61 
 
 
249 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  47.43 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  47.04 
 
 
248 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  50.2 
 
 
249 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  50.2 
 
 
249 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  47.04 
 
 
243 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  50.23 
 
 
216 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  50 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  47.27 
 
 
222 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  38.91 
 
 
252 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  38.13 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  39.6 
 
 
243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  38.46 
 
 
252 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  34 
 
 
242 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  39.61 
 
 
229 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  39.44 
 
 
250 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  38.11 
 
 
250 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  46.88 
 
 
96 aa  99.4  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  29.79 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  35.71 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  35.71 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  38.83 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>