36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2381 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2381  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00881734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0962  hypothetical protein  98.39 
 
 
249 aa  495  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2207  hypothetical protein  98.39 
 
 
249 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  0.777815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2846  hypothetical protein  79.52 
 
 
249 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0674  hypothetical protein  82.33 
 
 
249 aa  361  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0526  hypothetical protein  70.68 
 
 
249 aa  345  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3415  hypothetical protein  69.08 
 
 
249 aa  342  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.194582  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1407  hypothetical protein  69.48 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  0.945554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1637  hypothetical protein  66.27 
 
 
249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0447  hypothetical protein  67.87 
 
 
249 aa  335  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2337  hypothetical protein  69.48 
 
 
249 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000677124  unclonable  0.000000210338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1194  hypothetical protein  69.48 
 
 
249 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0187174  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1273  hypothetical protein  68.67 
 
 
249 aa  329  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1174  hypothetical protein  68.77 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4170  hypothetical protein  67.98 
 
 
253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4502  hypothetical protein  55.42 
 
 
248 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59700  hypothetical protein  54.62 
 
 
248 aa  294  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231653  hitchhiker  1.4536800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  56.22 
 
 
249 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  55.82 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59820  hypothetical protein  58.64 
 
 
216 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530233  hitchhiker  2.99054e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  45.38 
 
 
243 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2935  hypothetical protein  49.37 
 
 
242 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3306  hypothetical protein  47.91 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878573  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0327  hypothetical protein  41.77 
 
 
252 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4095  hypothetical protein  41.77 
 
 
252 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4178  hypothetical protein  40.5 
 
 
252 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1753  hypothetical protein  42.93 
 
 
229 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0633  hypothetical protein  42.5 
 
 
243 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0646  putative inner membrane protein  39.2 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3936  hypothetical protein  32.93 
 
 
242 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3717  hypothetical protein  39.83 
 
 
250 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1678  hypothetical protein  48.96 
 
 
96 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0359565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2763  hypothetical protein  28.29 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.405219  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2383  hypothetical protein  42.16 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1031  hypothetical protein  41.84 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1069  hypothetical protein  41.84 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>