35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3706 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  67.72 
 
 		 136 aa  154  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  51.45 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  51.45 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  52.17 
 
 		 141 aa  143  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  55.56 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  54.76 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  49.23 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  48.85 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  48.85 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  49.22 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  45.59 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  51.64 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  45.32 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  48.82 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  42.96 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  45.59 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  42.65 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  46.77 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  46.77 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  47.58 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  49.18 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  45.16 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  43.9 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  44.35 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  41.1 
 
 		 154 aa  100  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  42.86 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  41.94 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  41.94 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  42.48 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  39.06 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  36.52 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  31.54 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  25.38 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  25.38 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>