35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3423 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  88.28 
 
 		 146 aa  245  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  91.03 
 
 		 146 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  87.92 
 
 		 149 aa  228  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  84.72 
 
 		 146 aa  226  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  74.31 
 
 		 145 aa  224  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  88.59 
 
 		 149 aa  222  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  72.22 
 
 		 145 aa  221  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  89.68 
 
 		 146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  82.81 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  81.25 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  80.47 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  76.38 
 
 		 144 aa  203  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  69.78 
 
 		 154 aa  191  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  76.64 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  64.03 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  64.29 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  64.71 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  59.31 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  59.31 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  52.35 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  53.69 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  52.35 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  59.69 
 
 		 125 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  59.38 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  58.59 
 
 		 139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  44.12 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  42.45 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  44.53 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  39.53 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  39.84 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  37.86 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  34.59 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  28.47 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  28.47 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>