32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2756 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  323  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  42.36 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  42.36 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  41.78 
 
 		 139 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  40.14 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  38.41 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  40.44 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  35.33 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  39.06 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  41.5 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  36.13 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  41.46 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  38.62 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  40.3 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  40.34 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  39.33 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  40.34 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  40.3 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  39.84 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  39.67 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  36.67 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  39.53 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  38.76 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  34.72 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  37.14 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  65.22 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  43.06 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  35.56 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>