35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1185 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  299  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  93.15 
 
 
146 aa  256  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  88.36 
 
 
146 aa  234  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  91.03 
 
 
149 aa  232  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  95.24 
 
 
149 aa  232  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  76.03 
 
 
145 aa  226  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  90.41 
 
 
146 aa  224  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  91.27 
 
 
149 aa  221  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  71.92 
 
 
145 aa  218  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  82.81 
 
 
144 aa  207  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  81.25 
 
 
144 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  80.47 
 
 
144 aa  204  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  77.17 
 
 
144 aa  203  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  69.78 
 
 
154 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  77.37 
 
 
144 aa  188  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  66.43 
 
 
151 aa  183  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  64.03 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  66.91 
 
 
151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  60.69 
 
 
147 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  60.69 
 
 
147 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  56.25 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  56.25 
 
 
141 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  56.38 
 
 
141 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  61.54 
 
 
139 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  60.47 
 
 
125 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  60.77 
 
 
139 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  44.6 
 
 
136 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  45.59 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  44.12 
 
 
133 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  40.32 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  38.71 
 
 
126 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  38.16 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  32.88 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  25.87 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  25.87 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>