33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0661 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  286  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  63.36 
 
 
141 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  63.36 
 
 
141 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  63.36 
 
 
141 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  67.72 
 
 
133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  59.06 
 
 
139 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  59.06 
 
 
139 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  52.99 
 
 
147 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  56 
 
 
125 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  52.24 
 
 
147 aa  136  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  50.76 
 
 
151 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  51.59 
 
 
146 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  49.63 
 
 
134 aa  131  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  50.36 
 
 
151 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  52 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  43.45 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  45.99 
 
 
145 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  51.59 
 
 
144 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  51.59 
 
 
144 aa  123  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  47.66 
 
 
148 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  47.66 
 
 
146 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  47.62 
 
 
146 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  47.62 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  47.62 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  49.63 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  46.32 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  46.83 
 
 
149 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  42.61 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  40.82 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  32 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  31.78 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>