35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  308  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  97.96 
 
 		 147 aa  301  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  70.5 
 
 		 148 aa  210  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  68.21 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  66.89 
 
 		 151 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  60.69 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  59.31 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  64.29 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  63.49 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  65.08 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  62.7 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  62.7 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  65.08 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  62.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  60.16 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  61.6 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  60.32 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  54.84 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  59.26 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  58.52 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  63.7 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  62.4 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  56.3 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  56.72 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  56.72 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  50.38 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  49.23 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  37.01 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  41.5 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  31.39 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  28.89 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  28.89 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>