35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1627 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  100 
 
 
145 aa  303  7e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  86.9 
 
 
145 aa  267  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  73.97 
 
 
146 aa  206  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  75.34 
 
 
146 aa  203  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  78.57 
 
 
149 aa  199  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  75.34 
 
 
146 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  73.29 
 
 
146 aa  194  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  76.98 
 
 
149 aa  192  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  76.19 
 
 
149 aa  190  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  64.94 
 
 
154 aa  190  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  76.19 
 
 
144 aa  187  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  76.19 
 
 
144 aa  186  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  76.19 
 
 
144 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  65.52 
 
 
144 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  71.03 
 
 
144 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  60.69 
 
 
147 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  63.7 
 
 
148 aa  177  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  62.33 
 
 
147 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  62.04 
 
 
151 aa  176  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  62.77 
 
 
151 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  57.35 
 
 
139 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  59.38 
 
 
125 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  52.94 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  52.94 
 
 
141 aa  150  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  56.62 
 
 
139 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  53.68 
 
 
141 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  43.48 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  42.34 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  42.65 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  42.74 
 
 
133 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  37.88 
 
 
126 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  35.33 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  35.61 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  24.64 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  24.64 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>