33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1763 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  49.24 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  52 
 
 		 125 aa  129  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  45.65 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  48.15 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  52.85 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  45.19 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  53.66 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  45.93 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  51.64 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  52.5 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  43.48 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  50 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  49.19 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  45.52 
 
 		 154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  45.59 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  51.2 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  48.39 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  48.36 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  46.77 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  46.34 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  45.97 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  47.58 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  45.97 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  45.53 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  45.97 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  43.48 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  45.6 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  34.09 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  35.56 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  30.58 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>