35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1257 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  100 
 
 		 149 aa  306  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  88.97 
 
 		 146 aa  241  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  96.55 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  86.81 
 
 		 146 aa  233  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  88.59 
 
 		 149 aa  229  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  90.34 
 
 		 146 aa  225  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  87.25 
 
 		 149 aa  224  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  74.31 
 
 		 145 aa  221  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  71.14 
 
 		 145 aa  219  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  78.74 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  82.03 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  81.25 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  80.47 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  66.23 
 
 		 154 aa  193  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  75.91 
 
 		 144 aa  185  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  64.75 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  64.29 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  64.71 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  60.69 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  60.69 
 
 		 147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  52.35 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  52.35 
 
 		 141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  54.36 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  58.91 
 
 		 125 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  60 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  59.23 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  42.65 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  43.15 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  43.07 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  39.52 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  38.4 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  39.35 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  33.58 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  34.57 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  34.57 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>