35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3022 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  70.83 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  70 
 
 		 139 aa  180  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  58.59 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  57.46 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  62.4 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  58.73 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  59.38 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  63.2 
 
 		 144 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  62.9 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  58.4 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  63.2 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  62.4 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  61.29 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  57.26 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  59.2 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  59.2 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  57.48 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  57.58 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  58.4 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  58.4 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  56.8 
 
 		 149 aa  141  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  62.2 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  52.89 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  52.89 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  52.03 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  52 
 
 		 134 aa  129  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  53.6 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  51.64 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  43.9 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  35 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  40.44 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  38.02 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  31.88 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  31.88 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>