35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2393 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  296  9e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  97.22 
 
 		 144 aa  246  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  96.53 
 
 		 144 aa  246  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  81.94 
 
 		 144 aa  239  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  82.54 
 
 		 146 aa  217  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  84.03 
 
 		 144 aa  213  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  70.92 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  80.16 
 
 		 149 aa  207  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  80.95 
 
 		 146 aa  206  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  79.37 
 
 		 146 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  79.37 
 
 		 149 aa  204  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  67.38 
 
 		 145 aa  204  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  78.91 
 
 		 146 aa  202  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  77.78 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  77.04 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  66 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  66.67 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  66.9 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  64.71 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  63.97 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  62.14 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  62.99 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  61.43 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  57.66 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  56.93 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  57.66 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  47.86 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  46.76 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  43.41 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  37.8 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  42.76 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  32.82 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  32.1 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  32.1 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>