35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0647 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  270  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  43.9 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  42.74 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  45.76 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  44.92 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  39.23 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  44.09 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  44.09 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  40 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  41.32 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  41.32 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  43.65 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  40.32 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  39.1 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  41.8 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  39.37 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  39.02 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  39.84 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  39.02 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  39.02 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  42.48 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  42.06 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  38.84 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  38.84 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  38.84 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  41.53 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  36.84 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  32.77 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  65.22 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  26.27 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  26.27 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>