35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1399 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  100 
 
 
146 aa  301  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  93.15 
 
 
146 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  88.28 
 
 
149 aa  227  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  91.27 
 
 
149 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  82.88 
 
 
146 aa  223  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  73.97 
 
 
145 aa  223  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  87.67 
 
 
146 aa  220  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  70.55 
 
 
145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  88.89 
 
 
149 aa  217  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  81.25 
 
 
144 aa  209  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  82.03 
 
 
144 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  80.47 
 
 
144 aa  207  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  75.59 
 
 
144 aa  204  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  67.63 
 
 
148 aa  191  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  76.64 
 
 
144 aa  189  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  68.35 
 
 
154 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  66.43 
 
 
151 aa  186  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  66.91 
 
 
151 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  61.38 
 
 
147 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  63.7 
 
 
147 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  56.94 
 
 
141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  56.94 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  57.72 
 
 
141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  60.47 
 
 
125 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  60.94 
 
 
139 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  60.16 
 
 
139 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0661  hypothetical protein  46.04 
 
 
136 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  47.86 
 
 
133 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1763  hypothetical protein  47.06 
 
 
134 aa  120  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  41.8 
 
 
133 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3927  putative secreted protein  40.8 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2756  hypothetical protein  38.96 
 
 
161 aa  86.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.449847  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  32.19 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  26.57 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  26.57 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>