31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1061 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1061  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1023  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2391  hypothetical protein  49.61 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0436  putative secreted protein  25.36 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3423  putative signal peptide  35.8 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.410037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1165  putative secreted protein  34.57 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2352  hypothetical protein  34.57 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000432269  unclonable  0.00000015715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1257  putative secreted protein  34.57 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.525148  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1627  putative secreted protein  24.64 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4178  putative signal peptide  34.57 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0535453  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1185  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657598  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1399  putative secreted protein  33.33 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0860  hypothetical protein  43.75 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1443  hypothetical protein  43.75 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0682  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.166566  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2187  hypothetical protein  32.1 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4514  signal recognition particle GTPase  28.89 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59930  hypothetical protein  28.89 
 
 
147 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000257746  hitchhiker  0.00000000000507389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2393  hypothetical protein  32.1 
 
 
144 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0949  hypothetical protein  32.1 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.960717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36270  hypothetical protein  43.75 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0503  hypothetical protein  29.63 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179782  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2858  hypothetical protein  30.86 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.972087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0647  hypothetical protein  26.27 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.893708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3022  hypothetical protein  31.88 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529171  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3706  putative lipoprotein  25.38 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4087  putative lipoprotein  24.39 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4170  putative lipoprotein  24.39 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0336  putative lipoprotein  38.78 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3329  hypothetical protein  39.58 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136345  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2947  hypothetical protein  39.58 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>