25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1186 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  433  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  97.12 
 
 		 283 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  52.71 
 
 		 283 aa  208  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  39.06 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  36.22 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  36.7 
 
 		 272 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  35.33 
 
 		 272 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  33.7 
 
 		 280 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  32.04 
 
 		 274 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  30.05 
 
 		 274 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  30.05 
 
 		 274 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  29.51 
 
 		 274 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  30.05 
 
 		 274 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  33.16 
 
 		 310 aa  81.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  28.5 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  22.7 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  24.26 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  26.02 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1680  hypothetical protein  39.06 
 
 		 113 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250152  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  26.61 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  27.94 
 
 		 285 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  23.96 
 
 		 263 aa  42  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>