24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4488 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  71.37 
 
 
266 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  73.62 
 
 
266 aa  353  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  67.5 
 
 
265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  62.22 
 
 
272 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  61.63 
 
 
272 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  64.02 
 
 
275 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  54.47 
 
 
265 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  35.59 
 
 
283 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  33.74 
 
 
274 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  33.59 
 
 
274 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  33.59 
 
 
274 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  33.61 
 
 
274 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  38.89 
 
 
283 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  33.2 
 
 
274 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  24.8 
 
 
254 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  33.7 
 
 
208 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  32.79 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1680  hypothetical protein  56.06 
 
 
113 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250152  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  30.09 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  28.08 
 
 
275 aa  59.3  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  21.56 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  21.22 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  26.98 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>