24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3059 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  61.6 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  60.76 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  56.38 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  53.33 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  55.51 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  53.56 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  55.56 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  38.84 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  38.39 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  38.84 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  38.39 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  39.11 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  42.68 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  39.02 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  38.19 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  31.82 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  25.86 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  31.35 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1680  hypothetical protein  46.38 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250152  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  25.31 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  23.94 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  27.07 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  28.23 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>