14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1922 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  539  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  56.27 
 
 
275 aa  284  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  35.39 
 
 
285 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  34.68 
 
 
269 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  32.94 
 
 
264 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  27.07 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  24.68 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  29.61 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  24.68 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  29.61 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  29.61 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  26.21 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  23.44 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  20.97 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>