11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3617 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  62.75 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  56.72 
 
 		 269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  37.2 
 
 		 275 aa  195  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  35.39 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  22.01 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  22.12 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  23.92 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  21.74 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  22.17 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  26.11 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>