23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0311 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  75.56 
 
 		 275 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  66.26 
 
 		 265 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  64.41 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  63.49 
 
 		 280 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  63.14 
 
 		 266 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  61.16 
 
 		 272 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  53.33 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  37.7 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  38.59 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  35.02 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  35.02 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  35.02 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  35.17 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  34.6 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  36.7 
 
 		 208 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  32.1 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  25.82 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1680  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250152  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  27.9 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  22.35 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  22.01 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  26.72 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>