23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3146 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  97.74 
 
 		 266 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  71.6 
 
 		 280 aa  361  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  70.17 
 
 		 265 aa  344  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  62.55 
 
 		 272 aa  318  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  65.56 
 
 		 272 aa  313  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  62.7 
 
 		 275 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  60.31 
 
 		 265 aa  298  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  40.43 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  36.25 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  36.25 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  36.25 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  38.71 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  35.83 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  36.82 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  33.07 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  34.24 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  24.45 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1680  hypothetical protein  55.88 
 
 		 113 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250152  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  28.46 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  25.68 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  21.2 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>