14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00771 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  56.72 
 
 
285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  54.44 
 
 
264 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  38.08 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  34.68 
 
 
263 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  25.31 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  24.18 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  24.56 
 
 
265 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  25.68 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  24.21 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  24.77 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  23.87 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  30.63 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  23.67 
 
 
283 aa  42  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>