25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1094 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  587  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  97.12 
 
 
208 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  55.16 
 
 
283 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  38.89 
 
 
265 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  37.8 
 
 
272 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  38.16 
 
 
266 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  37.07 
 
 
275 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  37.72 
 
 
266 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  36.02 
 
 
280 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  36.82 
 
 
272 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  35.19 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  32.53 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  31.08 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  31.08 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  30.68 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  30.28 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  33.19 
 
 
310 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  27.95 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  22.53 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  23.62 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  27.92 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  25.86 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  23.21 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1680  hypothetical protein  40.28 
 
 
113 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250152  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  23.98 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>