23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5076 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  70.34 
 
 		 266 aa  342  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  69.92 
 
 		 266 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  67.5 
 
 		 280 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  65.5 
 
 		 272 aa  338  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  65.32 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  65.15 
 
 		 272 aa  313  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  54.44 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  35.22 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  34.33 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  35.29 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  35.18 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  35.43 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  34.8 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  34.78 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  33.47 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1680  hypothetical protein  57.14 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250152  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  28.69 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  25.27 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  22.79 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  22.18 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>