24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3820 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  26.84 
 
 
265 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  25.53 
 
 
280 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  24.56 
 
 
266 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  24.56 
 
 
266 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  25.86 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  25.75 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  25.82 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  26.38 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  24.89 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  22.67 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  22.67 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  22.67 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  22.49 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  22.67 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  23.18 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  22.17 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  24.18 
 
 
269 aa  58.9  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  22.57 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  23.77 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  23.44 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  23.92 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  22.7 
 
 
208 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  20.97 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>