23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0586 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  100 
 
 		 274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  98.91 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  98.91 
 
 		 274 aa  563  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  98.91 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  98.54 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  38.39 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  36.28 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  35.84 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0355  hypothetical protein  35.68 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880834  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  34.21 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  35.44 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  35.02 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  34.6 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5076  hypothetical protein  34.65 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  32.99 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  30.05 
 
 		 208 aa  89.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  22.67 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05641  putative signal peptide protein  25.74 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  24.68 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1680  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250152  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  23.83 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  21.63 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>