21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1924 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1924  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717695  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1922  hypothetical protein  56.27 
 
 
263 aa  284  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118563  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3617  hypothetical protein  37.2 
 
 
285 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00771  hypothetical protein  38.08 
 
 
269 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2373  hypothetical protein  36.95 
 
 
264 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00117889  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3820  hypothetical protein  23.77 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4488  hypothetical protein  28 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2299  putative signal peptide protein  26.8 
 
 
310 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1094  hypothetical protein  27.92 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.465854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0311  hypothetical protein  26.72 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3059  hypothetical protein  28.23 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3873  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.470356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3146  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0541  hypothetical protein  25.41 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0584  putative outer membrane protein  26.39 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0586  putative outer membrane protein  21.63 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.630248  normal  0.168933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1186  hypothetical protein  24.87 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0591  hypothetical protein  23.46 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.0623591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0646  hypothetical protein  25.69 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0583  putative outer membrane protein  25.69 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0958475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0460  hypothetical protein  27.09 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>