23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4975 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  237  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  87.93 
 
 
116 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  86.21 
 
 
116 aa  212  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  67.24 
 
 
117 aa  177  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  44.14 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  41.96 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  36.19 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  35.65 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  28.16 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  28.16 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  30.43 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  30.3 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  28.41 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  44.07 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  36.59 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  28.3 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  32.43 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  30 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  33.77 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  45 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  35.44 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>