19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1441 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  65.55 
 
 
129 aa  167  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  45.76 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  41.84 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  36.19 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  34.62 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  35.19 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  34.55 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  32.76 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  30.36 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  34.91 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  29.46 
 
 
128 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  33.96 
 
 
123 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  41.33 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  28.04 
 
 
134 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  31.25 
 
 
134 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  31.25 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  27.72 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>