23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0815 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  249  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  77.24 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  45.08 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  40.71 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  39.82 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  41.88 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  40.71 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  42.2 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  42.34 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  41.07 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  38.39 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  39.42 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  41.56 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  31.31 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  27.93 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  28.04 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  29.13 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  27.12 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  26.17 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  36.71 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>